Consiliul Director este ales prin vot de Adunarea Generală, adică de totalitatea membrilor înscrişi în asociaţia Habitat pentru Umanitate Cluj. Scopul lui este de a conduce organizaţia, a decide strategia de dezvoltare în concordanţă cu regulile Habitat for Humanity International şi de a lua deciziile necesare pentru continuarea programului Habitat. Toţi membrii Consiliului Director sunt voluntari şi nu sunt remuneraţi pentru activitatea depusă; dimpotrivă, ca orice membri ai unei organizaţii neguvernamentale, ei plătesc cotizaţie. Odată la trei ani, Adunarea Generală (adică toţi membrii înscrişi oficial în asociaţia Habitat pentru Umanitate Cluj) aleg un Consiliu Director, care să ia deciziile necesare bunului mers al organizaţiei şi să decidă direcţiile de dezvoltare. Consiliul Director este condus de un preşedinte.